歐盟啟動“類器官單細(xì)胞圖譜”項(xiàng)目
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HCA|Organoid是新啟動的歐盟研究項(xiàng)目,該項(xiàng)目結(jié)合了單細(xì)胞特征分析和類器官技術(shù),用以驗(yàn)證類器官是人類生物學(xué)的可靠模型。該項(xiàng)目旨在開發(fā)一個(gè)開放存取的“類器官單細(xì)胞圖譜”。它是歐盟地平線2020框架計(jì)劃資助的六個(gè)試點(diǎn)行動之一,將幫助歐洲完成對“人體細(xì)胞圖譜”工程的奠基(www.humancellatlas.org/euh2020)。
類器官是在體外生成的微型化和簡化的3D器官。
類器官用于在實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中研究疾病和治療方法。
HCA|Organoid將建立在線公開圖譜, 匯總并分享單細(xì)胞類器官數(shù)據(jù)。
類器官可以作為人類生理學(xué)和病理學(xué)的模型,可實(shí)現(xiàn)在人類身上難以或無法進(jìn)行的干預(yù)研究。同時(shí)這也減少了對動物實(shí)驗(yàn)的需求。類器官也可用于藥物開發(fā)和個(gè)性化醫(yī)療,例如癌癥治療或遺傳性疾病,如囊性纖維化。最后,類器官還有助于推動再生醫(yī)學(xué)的發(fā)展,其最終目標(biāo)是產(chǎn)生可移植到患者體內(nèi)的功能性生物結(jié)構(gòu)。
單細(xì)胞技術(shù)為理解生物學(xué)提供了一個(gè)全新的視角,具有推動治療進(jìn)展的深遠(yuǎn)潛力,并使歐洲處于個(gè)性化醫(yī)學(xué)和再生生物學(xué)的前沿。為了簡化研究并加速這一領(lǐng)域的科學(xué)進(jìn)步,人類細(xì)胞圖譜(HCA)項(xiàng)目倡議為建立人體所有細(xì)胞類型綜合參考圖譜這一目標(biāo)提供了全球性的協(xié)調(diào)。
在HCA的全球背景下,新的歐洲研究項(xiàng)目HCA|Organoid已經(jīng)著手建立“類器官單細(xì)胞圖譜”。這一舉措將在HCA內(nèi)建立人體類器官的單細(xì)胞分析,從而推動生物醫(yī)學(xué)研究。這一愿景在一份戰(zhàn)略文件中進(jìn)行了概述,該文件已作為預(yù)印本公開發(fā)表 (DOI: 10.5281/zenodo.4001718)。簡而言之,研究人員將把單細(xì)胞數(shù)據(jù)作為 "羅塞塔石",幫助從患者的組織樣本中獲得的結(jié)果和對體外生長的實(shí)驗(yàn)性更強(qiáng)的類器官(構(gòu)成實(shí)驗(yàn)室中的 "患者化身")之間進(jìn)行轉(zhuǎn)化。例如,研究人員可以在原發(fā)性患者樣本中確定一種新的疾病相關(guān)細(xì)胞類型,在人體類器官中創(chuàng)建等效細(xì)胞,然后在體外研究潛在的治療策略。
為實(shí)現(xiàn)這一愿景,HCA|Organoid項(xiàng)目最初將專注于建立單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組,以及人體類器官和來自健康捐贈者的匹配初級組織的時(shí)間序列成像。該項(xiàng)目將從100個(gè)個(gè)體中提取并全面描述人類大腦和結(jié)腸類器官的特征,以捕捉種群變異,為以疾病為中心的研究建立全面的參考。單細(xì)胞圖譜將被整合到一個(gè)公開的類器官細(xì)胞圖譜中,該門戶將為用戶提供與人類原始樣本相關(guān)的類器官單細(xì)胞數(shù)據(jù)。這一科學(xué)資源將支持多項(xiàng)概念驗(yàn)證研究,例如關(guān)注腦器官中遺傳性癲癇的疾病模型、結(jié)腸癌模型以及結(jié)腸器官中與疾病相關(guān)的遺傳變異的表征。
HCA|Organoid項(xiàng)目匯集了8個(gè)合作機(jī)構(gòu)的聯(lián)合體,包括來自奧地利、德國、荷蘭和瑞士的類器官、單細(xì)胞圖譜、高級成像和生物信息學(xué)方面的專家。除了最初專注于大腦和結(jié)腸類器官的單細(xì)胞剖析外,該項(xiàng)目還將啟動一個(gè)開放的、合作的研究人員和倡議網(wǎng)絡(luò),旨在對其他不同的人體類器官進(jìn)行單細(xì)胞表征。






