類器官和基因檢測(cè)報(bào)告的互補(bǔ)解讀
本文為轉(zhuǎn)載內(nèi)容,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系我們進(jìn)行刪除。 作者:秦粵仁 文章轉(zhuǎn)載于:普羅布諾(重慶)生物科技有限公司
目前用于藥物精準(zhǔn)篩選的技術(shù),主要是基因檢測(cè)和疾病模型(例如PDX和類器官)。
基因檢測(cè)(二代測(cè)序NGS)能篩出突變靶點(diǎn),從而輔助分析用藥方案,越來(lái)越受到各大指南的推薦。在2019年的NCCN指南中:
肺癌靶向用藥推薦檢測(cè)的基因類型,在原來(lái)八種(EGFR、KRAS、HER2、ALK、ROS1、MET、BRAF和RET)的基礎(chǔ)上新增了NTRK基因。
腸癌則首次明確,建議所有的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者,都應(yīng)進(jìn)行RAS(KRAS和NRAS)和BRAF基因檢測(cè)。可以單獨(dú)進(jìn)行檢測(cè),也可以作為NGS panel的一部分進(jìn)行檢測(cè)。同時(shí)還推薦所有的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者進(jìn)行NTRK基因檢測(cè)。
由于拉羅替尼的問(wèn)世,NTRK基因受到了格外的重視。這種邏輯是顯而易見的,先有治療藥物,基因檢測(cè)才有意義。倘若發(fā)現(xiàn)了變異基因,卻無(wú)藥可用,也是一種浪費(fèi)。
類器官和NGS的藥篩技術(shù),各有千秋。類器官暫且不能與血管共生,因此很難預(yù)測(cè)純VGER藥物的敏感性。基因測(cè)序則存在盲點(diǎn)和藥敏概率的不確定性,尤其是對(duì)于化療藥的預(yù)測(cè),以及發(fā)生耐藥以后的用藥選擇,左右為難。
類器官和NGS,各有裨益。不妨兩相結(jié)合,優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),這會(huì)幫助我們?cè)谟盟庍x擇上更加精準(zhǔn)和富有策略。下面舉四種不同情況來(lái)加以分析。
第一種情況,NGS和類器官在靶向制劑上的藥敏結(jié)果是一致的。
相對(duì)NGS,類器官測(cè)評(píng)化療藥的優(yōu)勢(shì)更為明顯,更加直觀和精準(zhǔn),這可以幫助我們辨識(shí)和修正NGS報(bào)告上對(duì)化療藥的推測(cè)性建議,比如“可能有效”或者 “可能耐藥”這種模糊的描述。如果只做化療藥的篩查,類器官無(wú)疑是最佳選擇。
第二種情況,NGS和類器官藥敏的結(jié)果有所背離。
這種小概率事件偶爾也會(huì)發(fā)生,孰是孰非,真理還需要用實(shí)踐來(lái)驗(yàn)證。北京協(xié)和醫(yī)院去年就出現(xiàn)過(guò)一例ALK陽(yáng)性的肺癌病例,該突變由于豐度太低,導(dǎo)致NGS漏檢。但類器官卻能在培養(yǎng)過(guò)程中,優(yōu)先培養(yǎng)具有異質(zhì)性的干性癌細(xì)胞,篩選出對(duì)ALK陽(yáng)性敏感的靶向藥,采用以后也確實(shí)奏效。
第三種情況,NGS沒有發(fā)現(xiàn)變異靶點(diǎn),或者發(fā)現(xiàn)靶向耐藥,然后求之于類器官檢測(cè)。
近期就碰到好幾個(gè)病例, NGS找不到突變靶點(diǎn),同時(shí)可選用藥極其有限。最后結(jié)合類器官檢測(cè)給出的信息,找到了用藥選擇的方向。至于晚期多發(fā)轉(zhuǎn)移的患者,出現(xiàn)耐藥的情況更為多見。在這樣的選擇困境中,向左還是向右?類器官正好可以給出答案。現(xiàn)實(shí)生活中,有相當(dāng)一部分患者就是在此情況下選擇類器官藥物篩選技術(shù)的。
第四種情況,沒有做NGS,只做類器官檢測(cè)。
對(duì)于早期患者,不少藥物的敏感性仍然保持足夠高的概率,根據(jù)指南就可以制訂比較完善的用藥方案。但是,盡信書不如無(wú)書,富有經(jīng)驗(yàn)的醫(yī)生并不會(huì)迷信指南,畢竟指南描述的也僅僅是大概率事件。對(duì)于每一位個(gè)體而言,因循指南或許有ABC的多重選項(xiàng),但是通過(guò)體外驗(yàn)證,則可以讓臨床判斷變得更加具有前瞻性,從而可以減少耐藥的風(fēng)險(xiǎn),為后續(xù)治療留多一點(diǎn)籌碼。
值得一提的是,個(gè)別病例也曾篩選出指南以外的藥物種類,通過(guò)知情同意后應(yīng)用于患者,竟也起到了顯著療效。這并不奇怪,人們對(duì)藥物和疾病機(jī)理的研究,其實(shí)是有限的。面對(duì)仍然未知的黑箱挑戰(zhàn),不如就讓體外替身-類器官來(lái)幫助我們探索吧。






